Szacunki opublikowane dzisiaj przez Centers for Disease Control and Prevention wskazują, że udział przypadków związanych z wariantami Omicron BA.4 i BA.5 wzrósł w ciągu ostatniego tygodnia o 79%. Oznacza to, że nawet gdy bardziej przenośna podwariant BA.2.12.1 Omicron stała się oficjalnie dominująca w Stanach Zjednoczonych w zeszłym tygodniu, jest już wypierana przez nowicjuszy BA.4 i BA.5. Rezultatem wydaje się być nakładanie się fal Omicrona.
Podczas gdy BA.2.12.1 zyskał przewagę dzięki temu, że był bardziej przenośny niż BA.2 wcześniej, mówi się, że dwa nowsze warianty atakują, przynajmniej częściowo, ze względu na ich zdolność do reinfekowania.
„Teraz raportujemy wyniki systematycznej analizy antygenowej tych rosnących podwariantów Omicron”, mówi niedawny artykuł opublikowany na serwerze preprintów BioRxiv. „BA.2.12.1 jest tylko nieznacznie (1,8-krotnie) bardziej odporna na surowice od osób zaszczepionych i wzmocnionych niż BA.2. Z drugiej strony, BA.4/5 jest znacznie (4,2-krotnie) bardziej oporny, a tym samym bardziej prawdopodobne, że doprowadzi do przełomowych infekcji szczepionkowych”.
Jeśli to prawda, oznacza to, że nowe warianty mają znacznie większą populację, do której mogą potencjalnie uzyskać dostęp poprzez przełomowe infekcje, podczas gdy poprzednie warianty, takie jak BA.2.12.1, powodowały znacznie mniej przełomowych infekcji.
Rezultatem jest to, co epidemiolog i biostatystyk dr Katelyn Jetelina — która bloguje pod pseudonimem Your Local Epidemiologist — dzwoni „bitwa pod Omikronem”.
„Po naszej pierwszej ogromnej fali BA.1”, dr Jetelina napisała dzisiaj w swoim biuletynie e-mail, „BA.2 próbowała utrzymać się tylko po to, by zostać wyprzedzonym przez BA.2.12.1. Teraz BA.4 i BA.5 bardzo szybko zyskują na popularności i wydają się z łatwością konkurować z resztą. Jednak biorąc pod uwagę ostatnie badania laboratoryjne, nie jest to niespodzianką. BA.4/5 są szczególnie dobre w ucieczce z przeciwciał i reinfekowaniu osób wcześniej zakażonych Omicronem, a także osób wzmocnionych.”
Opublikowane dzisiaj dane CDC pokazują BA.4 i BA.5, które zostały objęte oznaczeniem B.1.1.529, ale prawdopodobnie stanowią zdecydowaną większość nowych przypadków w tej grupie, wciąż ze skromnym 6,1% udziałem nowych przypadków analizowane pod koniec zeszłego tygodnia. Porównaj to z 59% dla BA.2.12.1 i 6.1% nie wydaje się dużo, ale fakt, że BA.4 i BA.5 w ogóle robią postępy, jest niezwykły.
Nawet gdy BA.2.12.1 nadal się rozwija, nowe południowoafrykańskie warianty spowalniają jego rozpowszechnianie. Podczas gdy BA.2.12.1 stanowi 59% zidentyfikowanych wariantów, to tylko wzrost w porównaniu z 52% w zeszłym tygodniu, co oznacza ogólny wzrost o około 7%. Jak wcześniej wspomniano, BA.4 i BA.5 wzrosły o 79%, z 3,4% do 6,1%.
Podobnie jak BA.2.12.1 przed nimi, nowe szczepy Omicron zakorzeniły się szybciej w niektórych częściach Stanów Zjednoczonych niż w innych. Podczas gdy BA.2.12.1 szybko rozprzestrzenił się najpierw na północny wschód, teraz to Środkowy Zachód — szczególnie Iowa, Kansas, Nebraska i Missouri — odczuwają największy ciężar BA.4 i BA.5.
Podczas gdy krajowy udział przypadków przypisanych tym wariantom wynosi w tym tygodniu 6,1%, w tym czterostanowym regionie jest to 12,4%. Obszar, w którym obserwuje się najmniejszy udział nowych szczepów, to region północno-wschodni, który został najbardziej dotknięty przez BA.2.12.1: Nowy Jork, New Jersey i Connecticut.
„Gdy BA.4/5 stanowi większość przypadków w Stanach Zjednoczonych, powinniśmy spodziewać się kolejnego (lub przedłużonego) wzrostu liczby przypadków” – napisał w tym tygodniu dr Jetelina. Tak więc, jako że fala BA.2.12.1 wydaje się rosnąć, z 7-dniową średnią krajową 106 000 nowych przypadków w dniu 21 maja według CDC i potencjalnie szczytową liczbą hospitalizacji w tym tygodniu, tuż za nią buduje się nowa fala, co prawdopodobnie oznacza znacznie wyższe dołek po BA.2.12.1 i stamtąd wzrost.
BA.4 został po raz pierwszy zidentyfikowany 10 stycznia 2022 r. w przypadkach sekwencjonowanych w Afryce Południowej na Outbreak.info. Ten kraj był również pierwszym, który zidentyfikował BA.5 26 lutego. Zajęło trochę czasu, zanim nowe warianty się wdrożyły, a codziennie rejestrowane przypadki w RPA wynosiły średnio około 12 000 do początku kwietnia.
BA.2 — w tym BA.2.12.1 — odpowiadał za prawie wszystkie codzienne przypadki w RPA pod koniec lutego. Jednak do końca kwietnia BA.4 i BA.5 znaleziono w 90% wszystkich dodatnich próbek testowych analizowanych w tym kraju. Spośród nich 70% to BA.4, a 22% to BA.5, według CovSpectrum.org, który pozyskuje dane z GSAID.
W Europie warianty południowoafrykańskie mocno uderzyły w Portugalię. Po raz pierwszy wykryto je w tym kraju w tygodniu 3 kwietnia. W ciągu mniej więcej ośmiu tygodni od tego czasu BA.5 stał się przyczyną 87% nowych przypadków, poinformował dziś Narodowy Instytut Zdrowia w tym kraju.
Dlaczego BA.4 zaczął dominować w RPA, a BA.5 w Portugalii, jest nadal kwestią otwartą. Aby zobaczyć, jak każdy z tych wariantów radził sobie w różnych krajach, kliknij tutaj.
W USA trudno powiedzieć, która wygra. To wciąż wczesne dni i wiele wariantów trackerów nie rozdziela ich osobno. W rzeczywistości, ponieważ testy laboratoryjne stają się coraz mniej rozpowszechnione, a lokalne budżety na nadzór są cięte, wykrywanie nowych szczepów jest coraz trudniejsze.
Na przykład Kalifornia nie oddziela nawet nowszych wariantów Omicron od starszych. Zamiast tego strona raportowania grupuje je wszystkie razem pod nagłówkiem „Omicron”, a ta kategoria całkowicie zdominowała wykres od 20 stycznia, oferując niewiele nowych danych. Ale jest kilka wskazówek.
Kalifornijski Departament Zdrowia Publicznego potwierdził Los Angeles Times, że jeden przypadek BA.4 został zidentyfikowany w marcu, a jeden przypadek BA.5 został udokumentowany w kwietniu.
Po skontaktowaniu się z Ostatecznym terminem w zeszłym tygodniu, kalifornijski departament zdrowia publicznego powiedział w oświadczeniu: „CDPH nie produkuje obecnie wewnętrznych szacunków wzrostu ani proporcji wariantów dla BA.4 lub BA.5 ze względu na ich względną rzadkość w tej chwili i dużą liczbę krążących podwarianty w konkurencji z BA.4 i BA.5.”
Oświadczenie brzmiało dalej: „Według danych CDPH, B.1.1.529 (zgodnie z kategorią CDC Nowcast obejmującą podwarianty BA.1, BA.3, BA.4 i BA.5) stanowią 1,5% krążących wariantów w CA w miesiąc maj.”
Jednak dane CDC przedstawione dzisiaj wskazują, że udział tych wariantów w kategorii „B.1.1.529” wynosi 6,6% (patrz mapa powyżej). Choć wciąż proporcjonalnie mała w stosunku do całości, kategoria ta wzrosła o 440%.
Wiadomości donoszą, że BA.4 i BA.5 pojawiły się w całym stanie w Bay Area w zeszłym tygodniu. Grupa potencjalnych przypadków została również niedawno zidentyfikowana w hrabstwie Yolo, niedaleko Sacramento. Dyrektor ds. zdrowia publicznego w Los Angeles, Barbara Ferrer, powiedziała na początku tego miesiąca, że zostali również zidentyfikowani w LA. Tak więc, chociaż stan nie ma danych na temat tych wariantów, lokalni urzędnicy ds. zdrowia mają pewien wgląd w ich rozprzestrzenianie się, a dowody wydają się wskazywać na coraz szybsze, nakładające się fale nowych wariantów.
Jak powiedział Ferrer we wtorek: „W ciągu kilku tygodni od dominacji jednego wariantu obaw, pojawiają się doniesienia z innych części kraju lub innych części świata o innych podtypach lub różnych szczepach, a dotyczy to szczególnie Omicron”.